調剤薬局のM&A

調剤薬局の売却、どこに相談するか

調剤薬局を売るときの相談先18社を、公式情報で比べました。仲介会社・FA・公的窓口・マッチングサイトに、自社で薬局を買うチェーン3社を加えています。手数料は譲渡額で大きく変わり、売り手無料をうたう仲介もあります。

18社を公式情報で調査（確認 2026-10-04）。現在、掲載会社から広告料・紹介料は受け取っていません。

結論：譲渡額の見込みで、相談先が変わる

大手仲介の最低報酬は2,000万〜2,500万円です。譲渡額が1億円なら、手数料は譲渡額の21〜25%になります。ストライクが公開する薬局の成約7件でも、対価は500万〜1億9,000万円でした。まず見込みの譲渡額で、相談先の種類を分けてください。

譲渡額の見込み	相談先の種類	比べる会社
5,000万円未満	公的窓口、マッチングサイト、売り手の手数料を低くしている薬局専門の仲介	事業承継・引継ぎ支援センター・バトンズ（調剤薬局の掲載876件）・ファーネットビズ（5,000万円以下は売り手の手数料なしと公式記載）・MACアドバイザリー（最低報酬なし。3,000万円で150万円）
5,000万〜1億円	最低報酬の低い仲介かFA。最低報酬2,000万円の会社だと、手数料が譲渡額の約2〜4割になる	MACアドバイザリー（5,000万円で250万円＝5%）・ファイブ・アンド・ミライ（5,000万円で530万円＝10.6%）・インテグループ（最低1,500万円。5,000万円なら30%）
1億〜3億円	薬局の成約実績を公開している仲介。最低報酬の差が大きく効く	ストライク（1億円で2,100万円＝21%）・インテグループ（1億円で1,500万円＝15%）・MACアドバイザリー（1億円で500万円＝5%）
3億円以上・複数店舗	薬局の仲介実績が多い大手。計算のもとが株式の譲渡額か資産の総額かで差が出る	M&Aキャピタルパートナーズ（3億円で2,500万円＝8.3%）・ストライク（3億円で2,100万円＝7%）・日本M&Aセンター

買い手に直接相談する場合：日本調剤・アイセイ薬局・総合メディカルは、自社が薬局を買う立場です。1社にだけ売る形になるので、価格を比べるなら仲介・FAとも並行して話を聞いてください。

ポイント（薬剤師が残るか）：開設者が変わる事業譲渡では、保険薬局の指定を新しく受けます。旧薬局の廃止日にさかのぼる指定（遡及指定）には、2026年9月から新しいルールが使われています。旧薬局の薬剤師の概ね8割以上、常勤の概ね5割以上を引き続き雇うことが、要件の一部です。

ポイント（報酬改定と立地）：2026年度改定で、調剤の改定率は+0.08%でした。同年6月以降に新規開設する門前薬局などには、15点の減算が新設されました。既存の薬局を承継した場合に「新規開設」に当たるかを明記した公的資料は、見つかっていません。

ポイント（処方元との関係）：処方箋の85%以上を特定の医療機関から受ける薬局は、2024年に39.3%でした。処方元の医療機関との関係は、仲介会社も薬局M&Aの要点に挙げています。誰がいつ医療機関に説明するかを、相談先に確かめてください。

注意

仲介会社は売り手と買い手の両方から報酬を受け取ります。売り手無料をうたう仲介は、買い手からの報酬で成り立つと書く会社もあります。売り手の側だけにつく相談先がよければFAを選びます。違いは仲介とFAの違いで説明しています。

売れそうな金額を選ぶと、売り手側の手数料（税別の目安）が安い順に並びます。株式の譲渡額を入れ、各社の料金表の基準（オーナー受取額・総資産など）は負債0として換算しています。「条件つき」は前提つきの試算です。評価の順番ではありません。

事業承継・引継ぎ支援センター：相談は無料（紹介された民間機関を使う場合は、その機関の手数料）

1
MACアドバイザリー仲介｜「毎年数十社、過去数百店舗の成約実績」「年間200～300社のオーナー様と面談」「日本全国…
500万円譲渡額の5%
2
ファイブ・アンド・ミライアソシエイツ仲介｜薬局の実績は未確認
530万円譲渡額の5.3%・条件つき
3
インテグループ仲介｜公開事例4件（累計件数は未公開）
1,500万円譲渡額の15%・最低報酬
4
ストライク仲介｜件数の記載なし。成約実績ページ「調剤薬局・ドラッグストア業界のM&A成約実績」に2003年…
2,100万円譲渡額の21%・最低報酬・条件つき
5
M&Aキャピタルパートナーズ仲介｜「300社以上、調剤薬局店舗では1300店舗以上の仲介実績」（調剤薬局業界チームページ）
2,500万円譲渡額の25%・最低報酬・条件つき
6
M&A総合研究所仲介｜専門ページ・体制の記載あり（件数は未公開）
2,500万円譲渡額の25%・最低報酬
7
fundbook仲介｜公開事例4件（累計件数は未公開）
2,500万円譲渡額の25%・最低報酬・条件つき